青之驱魔师讲述一位由恶魔撒旦与人类女子所生下的男孩奥村燐，在一次与收养他的藤本神父吵架中，发现了自己原来是大恶魔撒旦的私生子的身世。但与此同时，被撒旦附身的藤本神父却为了保护燐而自杀了……青之驱魔师的世界由两个空间组成，像镜子般地连为一体。有人类居住的物质界，及恶魔居住的虚无界。平常基本上无法接触或穿梭于两界之间。可是恶魔能凭依于相当的物质从而进入人类的世界。撒旦(サタン)众魔之神，为了从人间捡回一个能抑制他的箱子，而生下了『奥村燐』（他跟一人界女子生的儿子）。由恶魔撒旦与人类女子所生下的男孩奥村燐，在一次收养他的「藤本狮郎」吵架中，发现了自己原来不是藤本狮郎神父的儿子，而是撒旦之私生子。在此同时，藤本神父被撒旦附身，为保护燐而选择自杀了。但撒旦的密谋未能得到燐的认同，并要带燐返回虚无界。就这样，为对抗自身是恶魔撒旦之子的命运，并替已身亡的养父藤本神父报仇，向撒旦证明自己的存在，毅然决定成为一位出色的驱魔师，为打败他的生父撒旦，正式加入了正十字骑士团，用他那自身的蓝色火炎（恶魔）之力量向撒旦复仇，使燐展开了驱魔师之旅...
